Q
QuasiRecomb
Wydawca:
Armin Topfer
Przeskanowane pod kątem wirusów
Windows
Free
Ściągnij v1.0
30 pobrania
| Wersja | 1.0 |
|---|---|
| Wydawca | Armin Topfer |
| Data wydania | 6 maj 2013 |
| Data dodania | 6 maj 2013 |
| Wymagania systemu operacyjnego | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Wymagania | Java |
| Całkowita liczba pobrań | 30 |
| Cena £ | Free |
Opis
QuasiRecomb to lekka aplikacja działająca w konsoli poleceń, symulująca model Markowa do generowania wirusowych Quasispecies. Opisuje generowanie quasigatunków wirusa oraz metodę wnioskowania o jego parametrach poprzez analizę danych sekwencjonowania następnej generacji. Model jest weryfikowany na symulowanych danych, co pokazuje zaletę wyraźnego uwzględnienia procesu rekombinacji, i testowany przez zastosowanie do odczytów uzyskanych z eksperymentalnych próbek wirusa HIV. Oferuje implementację algorytmu EM w celu znalezienia maksymalnych oszacowań a posteriori parametrów modelu oraz metodę szacowania dystrybucji szczepów wirusowych w quasigatunkach.
