GenoSuite
| Wersja | 2.0.1 |
|---|---|
| Wydawca | Dhirendra Kumar |
| Data wydania | 2 maj 2013 |
| Data dodania | 2 maj 2013 |
| Wymagania systemu operacyjnego | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Wymagania | None |
| Całkowita liczba pobrań | 22 |
| Cena £ | Free |
Opis
GenoSuite to platforma opracowana do analizy proteogenomicznej. Strategia oparta na FDRScore służy do integracji wyników z wielu algorytmów wyszukiwania. Prokariotyczne narzędzie proteogenomiczne (PPT) zostało opracowane jako część frameworka GenoSuite. PPT służy do znajdowania nowych translacji w genomach prokariotycznych i jest zależny od danych proteomicznych opartych na spektrometrii mas i powiązanej sekwencji genomu. Funkcje obejmują skonfigurowanie 4 algorytmów open source do wyszukiwania w bazie danych w celu identyfikacji peptydów i można wybrać dowolną kombinację 4 algorytmów, wyświetla listę peptydów specyficznych dla wyszukiwania genomu (nowe peptydy), można wizualizować dopasowania spektralne w celu oceny jakości, wymienia można również wygenerować nowe białka i zmiany w istniejących adnotacjach białkowych oraz wizualny kontekst genomowy nowych peptydów.