MultiGeneBlast
| Wersja | 1.1.5 |
|---|---|
| Wydawca | MultiGeneBlast |
| Data wydania | 3 kwi 2013 |
| Data dodania | 4 kwi 2013 |
| Wymagania systemu operacyjnego | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Wymagania | None |
| Całkowita liczba pobrań | 95 |
| Cena £ | Free |
Opis
MultiGeneBlast to narzędzie typu open source oparte na przeformatowaniu nagłówków FASTA wpisów białkowych NCBI GenBank, za pomocą którego może śledzić ich źródłowe nukleotydy i współrzędne. MultiGeneBlast może pomóc w wykrywaniu takich wielogenowych części w projektach biologii syntetycznej. Syntetyczną bibliotekę operonów można utworzyć na podstawie jej danych wyjściowych, aby zidentyfikować te operony, których funkcja jest najbliższa pożądanej przez użytkownika. To narzędzie daje możliwość zidentyfikowania wszystkich homologicznych regionów genomowych poprzez połączenie wyników pojedynczych przebiegów BlastP dla każdego genu i sortowanie regionów genomowych z dowolnego wpisu GenBank według liczby trafień, zachowania syntenii i skumulowanego wyniku Blast bit. Przeszukiwania architektury można przeprowadzić, aby znaleźć dowolne regiony genomu z trafieniami wybuchowymi w dowolną określoną przez użytkownika kombinację sekwencji aminokwasowych.
