RightField

Opis

RightField może określić zakres dozwolonych terminów z wybranej ontologii (podklasy, indywidua lub kombinacje) dla każdego pola adnotacji. Wynikowy arkusz kalkulacyjny przedstawia te terminy użytkownikom w postaci prostej listy rozwijanej. Zmniejsza to barierę adaptacji do korzystania z ontologii społeczności, ponieważ adnotację tworzy naukowiec, który wygenerował dane, a nie osoba trzecia, a adnotacja jest gromadzona w czasie zbierania danych.

RightField to samodzielna aplikacja Java, która wykorzystuje Apache-POI do interakcji z dokumentami Microsoft. Umożliwia użytkownikom importowanie arkuszy kalkulacyjnych Excel lub generowanie nowych od podstaw. Ontologie mogą być importowane z ich lokalnych systemów plików lub z repozytorium ontologii BioPortal. Poszczególne komórki lub całe kolumny lub wiersze można oznaczyć wymaganymi zakresami terminów ontologicznych, a pojedynczy arkusz kalkulacyjny można opatrzyć adnotacjami terminami z wielu ontologii.

Po zaznaczeniu i zapisaniu arkusz kalkulacyjny z obsługą RightField zawiera „ukryte” arkusze z informacjami dotyczącymi pochodzenia i wersji ontologii użytych w adnotacji. Te informacje o pochodzeniu są ważne w przypadku przyszłych zmian w ontologii, które mogą spowodować deprecjację już wybranych wartości lub dodanie bardziej szczegółowych opcji i szybkiej ponownej adnotacji. RightField ma służyć jako narzędzie administratora. Rozszerza arkusze kalkulacyjne, które mogą już być zgodne z określonymi szablonami, aby jeszcze bardziej ujednolicić terminologię.