| Wersja | 2.75 |
|---|---|
| Wydawca | Apticraft |
| Data wydania | 19 gru 2016 |
| Data dodania | 19 gru 2016 |
| Wymagania systemu operacyjnego | Mac OS X 10.11, Mac OS X 10.9, Mac OS X 10.6, Mac OS X 10.10, Mac OS X 10.8, Mac OS X 10.7, Macintosh, macOSX (deprecated) |
| Wymagania | None |
| Całkowita liczba pobrań | 71 |
| Cena £ | Free to try |
Opis
PrimerPlex to wydajne i wyrafinowane narzędzie do projektowania oligonukleotydów do testów multipleksowych. Testy Multiplex ułatwiają amplifikację wielu celów w jednym naczyniu reakcyjnym, redukując zarówno czas, jak i koszty eksperymentów. PrimerPlex projektuje oligonukleotydy do multipleksowych testów PCR oraz do systemów opartych na macierzach zawiesinowych, takich jak Luminex 100, Luminex 200 i Bio-Plex 200. Takie systemy oferują wszechstronną platformę do wykrywania multipleksowanych kwasów nukleinowych w formacie 96-dołkowym. PrimerPlex projektuje specyficzne sondy wychwytujące do testów bezpośredniej hybrydyzacji oraz startery do testów Allele Specific PCR Extension (ASPE).
Testy multipleksowe są używane do analizy ekspresji genów (wykrywanie punktu końcowego za pomocą elektroforezy żelowej) oraz do zastosowań SNP o wysokiej przepustowości, takich jak genotypowanie, wykrywanie patogenów, typowanie szczepów i haplotypowanie. Aby zapewnić specyficzność, oligonukleotydy projektuje się po uniknięciu regionów homologii zidentyfikowanych przez wyszukiwanie BLAST. Następnie PrimerPlex sprawdza oligonukleotydy pod kątem reaktywności krzyżowej i minimalizuje niedopasowania Tm, aby uzyskać najlepszy możliwy zestaw multipleksów. W tym czasie analizuje miliony możliwych zestawów starterów multipleksowych w ciągu kilku sekund i przedstawia również listę alternatywnych zestawów.
