MD simulation for iPhone

Opis

Uniwersytet Ulsan, Szkoła Inżynierii Mechanicznej, MNTF (Inżynieria Płynów w Mikro/Nano) Lab. http://home2.ulsan.ac.kr/user/nanofluid/Proszę postępować zgodnie z poniższymi samouczkami dla kilku przykładowych przypadków. Wszystkie poniższe przykłady zakładają stany początkowe po ekranie ładowania. (dostosuj Dt, aby szybciej zobaczyć wynik. Wypróbuj również te z [WCA] i [Ideal]) 1. Symulacja przepływu Couette [Start] - poczekaj, aż system osiągnie równowagę - [Couette] - poczekaj, aż system osiągnie równowagę stan ustalony (Profile prędkości chwilowej dostępne w szarym polu po prawej stronie na dole) 2. Symulacja przepływu Poiseuille'a [Start] - poczekaj, aż układ osiągnie równowagę - [Poiseuille] - poczekaj, aż układ osiągnie stan ustalony 3. Dyfuzja symulacja [Init3,4,5] - ustaw temperaturę docelową na około 250~350K - [start] 4. Symulacja zamrażania i krystalizacji [Init3,4,5] - ustaw temperaturę docelową poniżej 80K - [start] 5. Więcej wskazówek ! Przycisk [Start] ustawia rozkład prędkości Maxwella-Boltzmanna na każdą cząsteczkę płynu. ! [L-J] dotyczy potencjału VDW opartego na parametrze molekularnym Argonu, [WCA] jest czysto odpychającą interakcją międzycząsteczkową, a [Ideal] pomija rozmiar i zderzenia cząsteczek, jak zakłada prawo gazu doskonałego. ! Możesz zwiększyć krok czasu (Dt), aby symulacje były szybsze, ale może to spowodować awarię symulacji i zresetowanie. ! Po zresetowaniu symulacji temperatura docelowa i krok czasu (Dt) ustawiają się na najniższą możliwą wartość. ! Możesz zmienić temperaturę docelową podczas symulacji i dostosować aktualną temperaturę za pomocą termostatu. ! Możesz rozpocząć symulacje w różnych warunkach początkowych za pomocą przycisku [Init] ! Przycisk [T/Tt] ustawia termostat na system z docelową temperaturą. Znacznik „CZERWONY” oznacza termostat skalujący prędkość, a znacznik „POMARAŃCZOWY” oznacza termostat Nose-Hoover. *** Dynamika molekularna w iPhone Argon Fluid w kanale 5 nm W ciągu ostatnich dwóch dekad rewolucyjny postęp w zakresie wysokowydajnych zasobów obliczeniowych stał się liderem badań nad dynamiką molekularną (MD) nad modelowaniem poziomu atomistycznego w komputerach osobistych. Teraz rozszerzam platformy MD o dostępne potężne urządzenia mobilne (iPhone) i może to być pierwsza próba w historii MD. Przepływy płynów w domenach mikronowych i nanoskalowych są często spotykane w elementach układów mikroelektromechanicznych, urządzeń mikroprzepływowych oraz w dyskach twardych komputerów. Na przykład w przypadku dysków twardych odległość między głowicą a nośnikiem jest rzędu kilkudziesięciu nanometrów. Przepływu płynu w tak małych skalach nie da się opisać za pomocą hipotezy continuum. Dynamika molekularna potencjalnie może rozwiązać te problemy, takie jak interfejsy ciała stałego i płynu/interakcje powstające w reżimie nanoskalowym. Co więcej, symulacje na dużą skalę oparte na modelach atomistycznych mogą również dotyczyć przejścia od podejścia atomistycznego do podejścia w skali kontinuum. Jest to kod dynamiki molekularnej (MD) (i2DMD) działający na iPhonie. Ten kod ma większość cech (ale uproszczony do wizualizacji i celów edukacyjnych) rzeczywistego kodu MD używanego w moich publikacjach w czasopismach SCI wymienionych w linku informacyjnym. Możesz symulować przepływ Couette'a, przepływ Poiseuille'a, dyfuzję i zamrażanie argonu w kanale 5 nm z okresowymi warunkami brzegowymi. Mam nadzieję, że ten przykładowy kod pomoże ludziom zrozumieć cząsteczkę w nanoskali