POY

Opis

POY to program do analizy filogenetycznej, który obsługuje wiele rodzajów danych (np. morfologię, nukleotydy, geny i regiony genów, chromosomy i całe genomy). POY wyróżnia się tym, że może przeprowadzić prawdziwe dopasowanie i wnioskowanie filogenetyczne, tj. sekwencje wejściowe nie muszą być wstępnie wyrównane. Insercje, usunięcia i rearanżacje można następnie uwzględnić w ogólnej punktacji drzewa w obszarze Maksymalna oszczędność lub w modelu w obszarze Maksymalne prawdopodobieństwo. W tym celu opracowano szereg algorytmów heurystycznych, które są zaimplementowane w POY.