| Wersja | 7.3 |
|---|---|
| Wydawca | Scalable Computing Laboratory |
| Data wydania | 28 maj 2009 |
| Data dodania | 28 maj 2009 |
| Wymagania systemu operacyjnego | Mac OS X 10.3.9/10.4 Intel/10.4 PPC/10.5 Intel/10.5 PPC |
| Wymagania | None |
| Całkowita liczba pobrań | 864 |
| Pobrania tygodniowo | 1 |
| Cena £ | Free |
Opis
MacMolPlt to narzędzie do wizualizacji chemii, które może być używane do budowania cząsteczek za pomocą zintegrowanego graficznego konstruktora modeli, tworzenia plików wejściowych dla programu chemii obliczeniowej GAMESS, a następnie wizualizacji wyników testów chemii obliczeniowej. Funkcje obejmują wysokiej jakości wyświetlacz 3D, animacje normalnych trybów i sekwencji reakcji oraz wyjście do różnych formatów, w tym wysokiej jakości obrazów oraz filmów QuickTime i Flash.
Dane wejściowe przy użyciu: Format pliku MolPlt wytłoczony przez GAMESS przez wklejenie współrzędnych kartezjańskich z dowolnego pliku dziennika GAMESS lub Gaussa, dowolnego pliku wejściowego, dziennika lub pliku IRC GAMESS, pliku XYZ w stylu Xmol, plików w formacie MolDen, pliku Protein Data Bank (pdb) w języku Chemical Markup Language (CML) pliki Buduj graficznie za pomocą interaktywnego edytora cząsteczek Buduj ręcznie przy użyciu współrzędnych wewnętrznych w stylu kartezjańskim lub Z-Matrix Wyświetlanie 3D struktury i tryb normalny Animacja trybów normalnych. Obrót i translacja 3D w czasie rzeczywistym pod kontrolą myszy Obliczanie dowolnego parametru macierzy Z Wizualnie mierz/wyświetlaj odległości, kąty i dwuścienne. Automatyczne tworzenie ścieżek liniowego najmniejszego ruchu (LLM) Obliczanie 2D i 3D oraz wyświetlanie: Orbitali molekularnych (AO, MO lub LMO) Różnic gęstości całkowitej gęstości elektronów Molecular Electrostatic Potentials (MEPMaps) Podstawowy generator plików wejściowych dla GAMESS OpenGL używany do jakość renderowania 3D Obsługa symetrii molekularnej Generowanie atomów zależnych od symetrii Określanie unikalnych atomów symetrii Automatycznie określaj listę obsługiwanych grup punktów dla zestawu współrzędnych. Obróć współrzędne do właściwej orientacji zasady Wyświetlaj operatory symetrii dla wielu grup punktów Jakość publikacji (kolorowa lub czarno-biała) poprzez bezpośrednie drukowanie lub kopiowanie i wklejanie do innej aplikacji. Wyjście w różnych formach, w tym bitmapy Windows, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, filmy Flash i filmy QuickTime.
