Przejdź do treści
CF

compsortall for Mac

Wydawca: Paul A. Wilson
Mac Free
Ściągnij v1.01 20 pobrania
Wersja1.01
Wydawca Paul A. Wilson
Data wydania25 sie 2008
Data dodania22 sie 2004
Wymagania systemu operacyjnegoMacintosh, Mac OS X 10.3
WymaganiaMac OS X 10.3
Całkowita liczba pobrań20
Cena £Free

Opis

Narzędzie wiersza poleceń do porównywania plików danych rozdzielanych przecinkami przy użyciu względnych różnic w celu określenia najbardziej podobnych konformacji. Compsortall porównuje pliki danych przy użyciu różnic względnych, oblicza wynik podobieństwa, sortuje wyniki od rdzenia w porządku rosnącym (niższe wartości oznaczają większe podobieństwo), zapisuje wszystkie wyniki w pliku tekstowym. Pliki danych tworzone przez użytkownika muszą być plikami tekstowymi oddzielonymi przecinkami. Każdy plik reprezentuje unikalną cząsteczkę. Każdy wiersz w pliku reprezentuje unikalną konformację cząsteczki. Pierwsza kolumna w pliku danych musi być etykietą unikatową dla konformacji reprezentowanej przez wiersz. Pozostałe kolumny to deskryptory numeryczne, takie jak pomiary odległości. Wiersze są porównywane kombinatorycznie między plikami. Porównywane etykiety są łączone i zapisywane z wynikami dla zestawu wierszy. Zapewnia to sposób identyfikacji konformacji, które dały dany wynik podobieństwa.

Przyszłe prace obejmują:

dodanie interfejsu GUI

opublikowanie artykułu na temat mojego algorytmu modelowania farmakoforów 3D

Wersja równoległa z wykorzystaniem MPI

Podobne programy

Alternatywy

Więcej od tego wydawcy