| Wersja | 1.01 |
|---|---|
| Wydawca | Paul A. Wilson |
| Data wydania | 25 sie 2008 |
| Data dodania | 11 sie 2004 |
| Wymagania systemu operacyjnego | Macintosh, Mac OS X 10.3 |
| Wymagania | Mac OS X 10.3 |
| Całkowita liczba pobrań | 29 |
| Cena £ | Free |
Opis
Narzędzie wiersza poleceń do porównywania plików danych rozdzielanych przecinkami przy użyciu względnych różnic w celu określenia najbardziej podobnych konformacji. Compsort porównuje pliki danych przy użyciu względnej różnicy, oblicza wynik podobieństwa, sortuje wyniki w porządku rosnącym (niższe wartości oznaczają większe podobieństwo), zapisuje liczbę X niskich wyników.
Pliki danych tworzone przez użytkownika muszą być plikami tekstowymi oddzielonymi przecinkami. Każdy plik reprezentuje unikalną cząsteczkę. Każdy wiersz w pliku reprezentuje unikalną konformację cząsteczki. Pierwsza kolumna w pliku danych musi być etykietą unikatową dla konformacji reprezentowanej przez wiersz. Pozostałe kolumny to deskryptory numeryczne, takie jak pomiary odległości.
Wiersze są porównywane kombinatorycznie między plikami. Porównywane etykiety są łączone i zapisywane z wynikami dla zestawu wierszy. Zapewnia to sposób identyfikacji konformacji, które dały dany wynik podobieństwa.
Przyszłe prace obejmują:
dodanie interfejsu GUI
opublikowanie artykułu na temat mojego algorytmu modelowania farmakoforów 3D
Wersja równoległa z wykorzystaniem MPI
